разумеется, масса атома - это сумма масс протонов-нейтронов и электронов
(которым можно пренебречь) входящих в егойный состав.

Но вот возьмем углерод.
Плотность алмаза, графита и угля разная, так как кристаллическая решетка разная,
а соответственно и плотность упаковки атомов.
При одном и том же элементе С три тела одинакового объема будут иметь разную массу.

главная ошибка кондовых материалистов
с их пластилинно-чугунным миром.

что я имел в виду.
Смотрите.
Что такое атом (по современным представлениям) - нечто вроде микро-планетарной системы,
где в центре кучка "слипшихся" протонов и нейтронов, вокруг которых по типа-орбитам
крутятся электроны.
Так ли это на самом деле - вопрос другой. Но схема работает, и даже
обладает предсказательным свойством - то есть, можно предсказать
наличие ранее не известных элементов или свойств их соединений.

При этом, сами элем.частица состоят из еще более гипотетичных частиц
следующего уровня мелкости.
А те, по принципу бесконечности вселенной, что вширь, что вглубь - из следующих.

То есть, МАССЕ как таковой в этой системе просто нет места.
ЧТО-ТО там точно есть - потому что ну вот же оно, на столе лежит и не падает.
То есть ОБЪЕКТИВНО масса существует, как и гравитация, как и силы инерции,
сопротивление среды и прочее.

Как там у классика?
Движенья нет! - сказал мудрец брадатый.
Другой же молча стал пред ним ходить.

Под "пластилинно-чугунным" видением мира я имел в виду
остановку мышления на таких понятиях как "масса", "вещество"
без дальнейших попыток понять - что они такое, и из чего сделаны сами.

как там в кф брат?
- А давай создадим фирму? "Братья Багровы" - звучит?
- А чем будем заниматься?
- Как чем?.. Бизнесом.

- Масса это свойство.
- Какое?
- НЕОТЪЕМЛЕМОЕ, чудак ты человек! А значит - ИЗНАЧАЛЬНОЕ!

Вот в теории эфира (все уточнения - у наше-все-Евгения) введено понятие "эфир"
как некая (и тоже - неизвестно что это, но точно-точно) прото-субстанция,
из которой сделано всё. То есть, вообще всё.
Может и так.
Но даже эфирщикам, по крайней мере тем из них, кто последователен,
приходится выдумывать (не в плохом смысле слова. То есть, достраивать гипотезу)
эфир-2, как субстанцию из которой сделан эфир-1. Весь.
Ну и снова и так далее вглубь до бесконечности.

С одной стороны логично: если вселенная бесконечна вширь, то и вглубь почему бы и нет?
С другой, такие построения не имеют смысла. И на практике можно остановиться на
таких пластилинно-чугунных понятиях, как механика, сопромат, химия.
То есть, воспринимать вещество как нечто однородное с некими заданными кем-то свойствами,
присущими им изначально. Аллах акбар!
Ну... Ладно, снизойдем до атомов и химии с ними.

Но например, почему все протоны и нейтроны одинаковы, как под копирку?
Они не усредненно-одинаковы - ибо в таком случае умники нашли бы способ
их тоже сортировать по массе. Но нет. Они совершенно одинаковы.

Планеты и звезды все разные, а протоны и нейтроны - одинаковы.
В чем тут причина?
И не говорит ли это о том, что все таки вглубь вселенная не бесконечна?
Ну примерно как информация - вверх она бесконечна, а вглубь - меньше 1 бита ничего нет.