Человеческий глаз действительноив полной темноте может отследить одиночный фотон. Это в частности хорошо объясняет мерцание далеких звезд. Вы улавливаете свет оттзвезды в виде одинозных фотонов через какие-то промежутки времени.

Далее. Когда фотон налетает на одиночный атом вне кристаллической решетки, он поглощается, а потом испускается. Должен сработать закон сохранения импульса и энергии как при абсолютно упругом столкновении шаров. Но вылетевший фотон обязан иметь ту же энергию, а значит и импульс, что и налетевший фотон. А это возможно только тогда, когда фотон как бы пролетел сквозь атом без потерь. Единственная потеря, это временная задержка между поглощением и испусканием, которая в кристаллической решетке и приводит к изменению скорости света в среде.
Но в кристаллической решетке атомы "чувствуют" друг друга. Поэтому несмотря на то, что вылетевший фотон имеет туже энергию, что и влетевший, а значит и величину импульса, направление импульса может слегка отличаться от первоначальной. Что приводит к частичному рассеянию в стекле и других достаточно прозрачных материалах.